Vainon syyt aukeavat ymmärtämällä Kiinan kommunistisen puolueen historiaa. Puolue on pysynyt vallassa väkivaltakoneistonsa turvin. Valtakautensa aikana se on tukahduttanut monia itsenäisesti ajattelevia ihmisiä, jotka eivät ole uskoneet Puolueen viralliseen ideologiaan: ”taisteluun”, ateismiin, marxismi-leninismiin ja maolaisuuteen sekä dialektiseen materialismiin. Falun Gong ei ole poliittinen tai vallankumouksellinen liike, mutta se on ikivanhaa kulttuuriperintöä ”vanhasta” Kiinasta, jossa sen kaltaiset kultivointimenetelmät kuuluivat henkisen sivistyksen ytimeen.

Boxun.Net julkaisi 26. huhtikuuta 2002 artikkelin, jossa todettiin että todellinen syy hallitsevan kommunistipuolueen suorittamalle vainolle Falun Gongia vastaan on moraalinen konflikti näiden kahden välillä. Kiinan kommunistipuolue toimii ja on toiminut koko historiansa ajan periaatteiden ”Teeskentely, Pahuus, Konflikti” mukaisesti. Ristiriidan vastakkaisella puolella on ihmisten pyrkimys moraaliseen elämäntapaan Falun Gongin periaatteiden mukaan keskittyen periaatteiden ”Totuus, Laupeus, Kärsivällisyys”, ympärille.

Kiina-analyytikot ja -asiantuntijat ovat esittäneet kolme pääasiallista syytä perusteettomalle Falun Gongin vainolle.

Huhtikuun 25. päivä 1999 yli 10 000 Falun Gongin harjoittajaa oli kokoontunut rauhanomaisesti Fuyoukadulle Pekingissä vedotakseen Kiinan valtionneuvoston valitustoimistoon 45 harjoittajan vapauttamiseksi. Poliisit olivat pidättäneet laittomasti nämä 45 henkilöä Tianjinissa kahtena edellisenä päivänä. Tapahtuma sai välittömästi kansainvälisesti huomiota, koska Fuyoukatu sijaitsee aivan kommunistipuolueen päämajan, Zhongnanhain, vieressä. Kiinan hallitus käytti tapausta myöhemmin hyväkseen syyttämään Falun Gongia ja siten oikeuttamaan vainon. Miksi 25. huhtikuuta ollut välikohtaus tapahtui? Miksi kielto tapahtui? Tämä artikkeli antaa muutamia vastauksia tärkeisiin kysymyksiin ja oikaisee väärinkäsityksiä tapahtuman ympäriltä.

Huhtikuun 25. päivänä 1999 sattuneesta ”Zhongnanhai-välikohtauksesta” on nyt kulunut vuosi, ja yli vuosi on myös kulunut Falun Gongin jatkuvasta vainoamisesta, jonka takana on pieni ryhmä Kiinan korkeissa asemissa olevia henkilöitä. Näitä henkilöitä ihmetyttää tällä hetkellä monet valtiot ja ihmiset, jotka ovat saaneet tietää vainon takana olevasta totuudesta. Heitä ihmetyttää avoin Falun Gongin tukeminen, Zhen – Shan – Renin (Totuus – Laupeus – Kärsivällisyys -periaatteiden) kunnioittaminen sekä julman vainon paljastaminen ja tuomitseminen. Kiinassa on kuitenkin yhä väärinkäsityksiä, jotka liittyvät huhtikuun 25. päivän tapahtumiin. Tämä johtuu suurimmaksi osaksi siitä, että ihmiset on ”hukutettu” hallituksen kontrolloimien tiedotusvälineiden valheellisiin uutisiin.